Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog1Q9Z160 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms