Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne6Q9Z140 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms