Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup160Q9Z0W3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup160Q9Z0W3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms