Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lhx9Q9WUH2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx9Q9WUH2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms