Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IncenpQ9WU62 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms