Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lemd3Q9WU40 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lemd3Q9WU40 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms