Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms