Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50bQ9WTJ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam50bQ9WTJ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50bQ9WTJ8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50bQ9WTJ8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50bQ9WTJ8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50bQ9WTJ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms