Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TapbpQ9R233 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms