Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf7Q9R1C0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf7Q9R1C0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms