Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp11cQ9QZW0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms