Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc3Q9QZC1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms