Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VapbQ9QY76 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms