Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx8Q9QXV1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms