Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip3Q9QXT8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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