Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Homer2Q9QWW1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms