Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcea2Q9QVN7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms