Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dkk3Q9QUN9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk3Q9QUN9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms