Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RhoaQ9QUI0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhoaQ9QUI0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms