Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Txnrd1Q9JMH6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms