Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FancaQ9JL70 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FancaQ9JL70 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms