Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl39Q9JKF7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mrpl39Q9JKF7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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