Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Scamp5Q9JKD3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms