Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msgn1Q9JK54 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms