Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smpd3Q9JJY3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smpd3Q9JJY3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms