Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Alyref2Q9JJW6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms