Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms