Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl28Q9JIL2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms