Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2ird1Q9JI57 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2ird1Q9JI57 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms