Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htr3bQ9JHJ5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms