Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmod3Q9JHJ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms