Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf3Q9ET30 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf3Q9ET30 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms