Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rb1cc1Q9ESK9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms