Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MesdQ9ERE7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MesdQ9ERE7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms