Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms