Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clca3a2Q9EQR4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms