Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SgshQ9EQ08 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SgshQ9EQ08 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms