Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tlr1Q9EPQ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tlr1Q9EPQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tlr1Q9EPQ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tlr1Q9EPQ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tlr1Q9EPQ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms