Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clstn1Q9EPL2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms