Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a3Q9DCP2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms