Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde1Q9DBZ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syde1Q9DBZ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms