Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Swt1Q9DBQ9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Swt1Q9DBQ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Swt1Q9DBQ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Swt1Q9DBQ9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Swt1Q9DBQ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Swt1Q9DBQ9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Swt1Q9DBQ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms