Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop5Q9DB28 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms