Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmbim4Q9DA39 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms