Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn34b2Q9D9N2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms