Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TcimQ9D915 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TcimQ9D915 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms