Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl40Q9D783 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl40Q9D783 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms