Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11fip1Q9D620 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11fip1Q9D620 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms