Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PrameQ9D4Z5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrameQ9D4Z5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms