Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
4930556J24RikQ9D4U7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms